top of page

АРХИВ НОМЕРОВ ЖУРНАЛА "БИООРГАНИЧЕСКАЯ ХИМИЯ"

(2022–2028)

2022 (1 2 3 4 5 6)    2023 (1 2 3 4 5 6)    2024 (1 2 3 4 5 6)

1, 2022

2022

2022, том 48, номер 1

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

ОБЗОРНЫЕ СТАТЬИ

Супрамолекулярные комплексы протеинов с макрогетероциклическими соединениями – уникальные структуры, существенно отличающиеся от классических супрамолекул как сложностью организации, так и многофункциональностью. Изучение природных и создание синтетических супрамолекулярных систем позволяет влиять на биохимические процессы и управлять ими, а также открывает новые перспективы практического использования макрогетероцикл-протеиновых супрамолекул. Ежегодно возрастающий интерес к изучению супрамолекулярных систем обусловлен их вариабельностью, разнообразием исходных компонентов, возможностью их химической и биохимической модификации, способностью участвовать в фото- и термоиндуцированных реакциях. Макрогетероциклический компонент супрамолекулярной системы не только влияет на аффинность протеиновой части к другим лигандам, но и может придавать супрамолекуле новые свойства. В обзоре проанализированы и обобщены результаты теоретических и экспериментальных исследований движущих сил самоорганизации молекул, процессов образования супрамолекулярных комплексов. Особое внимание уделено исследованиям супрамолекул протеин–макрогетероцикл, имеющих прикладную направленность для создания искусственных фотосистем, применения в биомедицинских целях в фотодинамической, фототермической терапии, для фотоинактивации бактерий, медицинской диагностики. Обозначены проблемы, сложности в развитии каждого направления и потенциальные пути их решения. Ключевые слова: супрамолекулярные системы, протеины, макрогетероциклы, самосборка ​​​ Биоорг. химия, Т. 48, c. 3–31 DOI: 10.31857/S0132342322010079

В продолжение рассмотрения синтетических аналогов одного из наиболее изученных природных полифенолов – ресвератрола – вторая часть обзора посвящена структурам, полученным благодаря трансформации этиленового фрагмента, соединяющего бензольные кольца в остове природного прототипа. Основное внимание уделено методам синтеза и выявленным физиологическим эффектам структур, в которых кратная связь трансформирована в гетероциклический фрагмент. Модификация такого рода направлена на снижение конформационной подвижности молекулы и способствует жесткой фиксации структуры в той или иной активной конфигурации. Ключевые слова: ресвератрол, гетероциклические аналоги, конформационные ограничения, антиоксиданты, противоопухолевая активность, противовоспалительная активность, активаторы хиноноксидоредуктазы 1, ингибиторы ароматазы Биоорг. химия, Т. 48, c. 32–52 ​DOI: 10.31857/S0132342322010110

В 1970 г. на основе данных о распаде аминокислот у позвоночных американский биохимик Альберт Ленинджер составил схему введения углеродных скелетов аминокислот в цикл Кребса, объединив аминокислоты в семь групп. Эта схема до сих пор используется в различных учебниках и справочниках по биохимии. Однако в ней имеются устаревшие сведения. Кроме того, Ленинджер занес каждую аминокислоту в одну из этих семи групп, между тем как для животного организма характерно иное превращение некоторых аминокислот. Что касается выводов насчет глюкогенного либо кетогенного действия той или иной аминокислоты, то они не всегда соответствуют данной схеме. В настоящем обзоре на основе современных данных о превращении аминокислот приводится уточненная автором схема введения углеродных скелетов аминокислот в цикл Кребса и полностью соответствующие ей выводы о глюкогенном либо кетогенном действии той или иной аминокислоты. Ключевые слова: треонин, триптофан, лизин, глюкогенное действие, кетогенное действие Биоорг. химия, Т. 48, c. 53–62 DOI: 10.31857/S0132342322010080

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

Пятнадцать белковых конъюгатов пенициллинов и цефалоспоринов, содержащих амино- и/или карбоксильные группы в исходных структурах, синтезированы в реакциях с сывороточным альбумином человека или овальбумином с использованием 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимид гидрохлорида (EDC) или комбинации EDC/N-гидроксисульфосукцинимид (sNHS) при различных соотношениях базовых реагентов. Проведено сравнительное исследование состава и свойств конъюгатов методами УФ-спектроскопии, масс-спектрометрии и лиганд-рецепторного анализа. Показано, что содержание остатков антибиотика в полученных макромолекулах варьируется от 1 до 22, бета-лактамный цикл остается интактным, и это обеспечивает специфическое взаимодействие конъюгатов с пенициллин-связывающим белком. В двух разработанных моделях рецепторных биоаналитических систем конъюгат ампициллина на твердой фазе взаимодействует с пенициллин-связывающим белком в составе его комплекса с моноклональным антителом, которое детектировали с использованием иммуноферментной метки в микропланшетах или наночастиц золота на тест-полосках. Связывание конъюгированного ампициллина с рецептором конкурентно ингибировалось антибиотиками, добавленными в жидкую фазу, и показатели аналитической чувствительности в отношении пенициллина G для микропланшетной и рецепторно-хроматографической тест-систем составили 0.05 и 1 нг/мл соответственно. Ключевые слова: гаптен-белковые конъюгаты, бета-лактамы, рецепторный анализ, антибиотики Биоорг. химия, Т. 48, c. 63–74 DOI: 10.31857/S0132342322010122

Конъюгаты аминопенициллинов с белками: синтез, иммуногенные свойства, связывание с рецептором бета-лактамов и антителами

О. С. Куприенко, Т. С. Серченя, И. И. Вашкевич, И. В. Горбачева, А. И. Зильберман, О. В. Свиридов

Предложен новый подход к модификации аминопенициллинов и получению их конъюгатов с белками с использованием ди-N-гидроксисукцинимидных эфиров дикарбоновых кислот в качестве кросс-линкеров. Ацилирование ампициллина (Amp) и амоксицилина (Amox) ди-N-гидроксисукцинимидными эфирами адипиновой или терефталевой кислоты проводили в диметилформамиде. Последующее конъюгирование полученных производных аминопенициллинов с белками протекало в водной среде при рН 8.3, в результате чего синтезированы иммуногенные и ферментные конъюгаты Amp и Amox. Показано, что в результате химических модификаций Amp и в ходе синтеза линкерных конъюгатов не происходит разрушение бета-лактамного цикла антибиотика. В ходе длительной иммунизации кроликов иммуногенным конъюгатом Amp с тироглобулином, содержащим ароматический линкер, получены поликлональные антитела, способные с очень высокой чувствительностью связывать Amp, Amox и пенициллин G. Конъюгаты аминопенициллинов с пероксидазой из корней хрена охарактеризованы в конкурентном белок-связывающем (рецепторном) анализе, а также в системе прямого конкурентного иммуноферментного анализа (ELISA). Из исследованных модельных иммуноаналитических систем наилучшими характеристиками в отношении определения Amp обладала система гетерологичного прямого ELISA с использованием полученных поликлональных антител и синтезированного конъюгата Amp c пероксидазой, в котором в качестве линкера использован фрагмент адипиновой кислоты: аналитическая чувствительность составила 0.03 нг/мл, IC50 = 0.20 нг/мл. Ключевые слова: пенициллины, бета-лактамные антибиотики, гаптен-белковые конъюгаты, рецепторный анализ, иммуноферментный анализ Биоорг. химия, Т. 48, c. 75–86 DOI: 10.31857/S0132342322010067

Разработаны методы получения новых конденсированных производных пиридо[3',2':4,5]тиено[3,2-d]пиримидинов на основе 5,6-диметил-2-оксо-1,2-дигидропиридин-3-карбонитрила. Осуществлены реакции замещения в 3-м и 4-м положениях 7,8-диметилпиридо[3',2':4,5]тиено[3,2-d]пиримидин-4(3H)-она. Исследована нейротропная активность 12 полученных соединений in vivo на крысах и мышах. У восьми соединений обнаружено противосудорожное действие по антагонизму с коразолом. Четыре отобранные соединения обладали анксиолитическим и активирующим поведение действием. Проведен молекулярный докинг синтезированных соединений для предсказания их взаимодействия с GABAA-рецептором. Выявлено пять соединений, комплексообразование которых с GABAA-рецептором осуществляется в двух местах: бензамидиновом сайте субсайта 1 и субсайте 3 интерфейса ECD, что свидетельствует об ингибирующем действии соединений на мишень. Ключевые слова: тиено[2,3-b]пиридин, пиридо[3',2':4,5]тиено[3,2-d]пиримидин, реакция Ниментовского, нейротропная активность, молекулярный докинг Биоорг. химия, Т. 48, c. 87–97 DOI: 10.31857/S0132342322010031

Синтез, нейротропная активность и молекулярный докинг новых конденсированных производных тиено[2,3-b]пиридина

В. В. Дабаева, М. Р. Багдасарян, Р. Г. Пароникян, И. М. Назарян, А. Г. Акопян, Л. С. Унанян, Е. Г. Пароникян, Ш. Ш. Дашян

Исследовано влияние природы фторхинолонов (на примере ципрофлоксацина и левофлоксацина) и их комплексообразования с метил-β-циклодекстрином на взаимодействие лекарственного препарата с сывороточным альбумином человека. Установлено, что на связывание лекарственной молекулы с альбумином существенно влияет структура фторхинолона, а также присутствие метил-β-циклодекстрина. С применением методов кругового дихроизма и флуоресцентной спектроскопии было установлено, что из двух фторхинолонов с белком сильнее взаимодействует более гидрофобная молекула ципрофлоксацина. Также было показано, что связывание альбумина с лекарством вызывает тушение флуоресценции белка, причем данный эффект более выражен для ципрофлоксацина. Комплексообразование фторхинолонов с метил-β-циклодекстрином приводит к изменению характера взаимодействия фторхинолонов с белком: в случае комплексов наблюдаются более выраженные взаимодействия для левофлоксацина. Полученные результаты открывают новые перспективы использования фторхинолонов в клинической практике путем разработки высокоэффективных препаратов с усовершенствованными свойствами. Ключевые слова: сывороточный альбумин человека, фторхинолоны, метил- -циклодекстрин, флуоресцентная спектроскопия Биоорг. химия, Т. 48, c. 98–108 DOI: 10.31857/S0132342322010146

Используемый в рутинной практике генотипический анализ, основанный только на одном локусе генома, не позволяет детектировать рекомбинантные формы вирусов с высокой степенью вариабельности генома в районе точки рекомбинации. На примере рекомбинантной формы RF1_2k/1b вируса гепатита С нами показана возможность ее определения с использованием подхода “много зондов/один спот”. Анализ клинических образцов сыворотки крови показал, что данный подход дает возможность провести однозначное отнесение выявленного в этих образцах вируса гепатита С к субтипам 2k, 1b или их рекомбинанту RF1_2k/1b. Ключевые слова: вирус гепатита С, рекомбинант RF1_2k/1b, “много зондов/один спот”, микрочип, POC-диагностика Биоорг. химия, Т. 48, c. 109–114 DOI: 10.31857/S0132342322010092

Изменение метаболизма сфингомиелина и церамида в структурах головного и спинного мозга трансгенных мышей линии FUS (FUS(1-359)), моделирующих боковой амиотрофический склероз

М. А. Шупик, У. А. Гутнер, А. А. Устюгов, А. П. Резвых, С. Ю. Фуников, О. А. Малошицкая, С. А. Соколов, А. Т. Лебедев, А. В. Алесенко

Обнаружены изменения экспрессии генов ферментов метаболизма сфинголипидов у трансгенных мышей линии FUS (FUS(1-359)), моделирующих боковой амиотрофический склероз (БАС). Проанализированы профили молекулярных видов сфингомиелинов (СМ) и церамидов (ЦЕР) в структурах головного мозга и в спинном мозге. В процессе развития БАС изменения в спектре молекулярных видов ЦЕР отмечены только в спинном мозге, где уровни практически всех ЦЕР снижаются по отношению к контролю через 2 и 3 месяца течения заболевания. Через 4 месяца развития патологии наблюдается повышение экспрессии гена кислой церамидазы, в результате чего может образовываться сфингозин, обладающий выраженными проапоптотическими свойствами. Анализ экспрессии генов ферментов обмена ЦЕР и галактозилцерамида (ГалЦер) указывает на возможность участия ГалЦЕР в качестве источника для поддержания уровня ЦЕР на терминальной стадии БАС. Таким образом, метаболизм сфинголипидов представляет собой перспективную область исследования процессов, связанных с БАС, как в контексте поиска потенциальных диагностических маркеров и эффективных лекарственных средств, так и для объяснения патогенеза БАС. Ключевые слова: боковой амиотрофический склероз, трансгенные мыши линии FUS(1-359), сфингомиелин, церамид, церамидазы, галактозилцерамидаза, галактозилцерамидсинтаза Биоорг. химия, Т. 48, c. 115–126 DOI: 10.31857/S0132342322010134

2, 2022

2022

2022, том 48, номер 2

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

ОБЗОРНЫЕ СТАТЬИ

Гиалуроновая кислота (ГК) – природный полисахарид, построенный из чередующихся остатков β-D-глюкуроновой кислоты и N-ацетил-β-D-глюкозамина. ГК входит в состав гликопротеинов и протеогликанов, которые выполняют важные функции в живых организмах. Например, ГК играет ключевую роль в развитии таких процессов, как деление и миграция клеток, формирование сосудов, воспаление, онкогенез. В обзоре рассмотрены реализованные синтезы олигосахаридов, родственных цепям ГК, проанализированы стратегии сборки соответствующих углеводных цепей, а также оценены типы использованных гликозил-доноров и гликозил-акцепторов, рассмотрены стратегии выбора защитных групп в использованных реагентах. Рассмотрены также работы, проводившиеся с использованием ферментативного расщепления природных образцов ГК и хондроитинсульфатов с целью получения соответствующих низкомолекулярных олигосахаридов. Синтезированные олигосахариды и гликоконъюгаты на их основе – ценные модели для установления взаимосвязи структуры и биологических свойств ГК и для разработки подходов к созданию терапевтических препаратов на основе ГК (в том числе для заживления ран, лечения воспалительных процессов), а также ингибиторов некоторых этапов онкогенеза. Ключевые слова: гиалуроновая кислота, полисахариды, синтез, гликоконъюгаты, биологическая активность Биоорг. химия, Т. 48, с. 129–161 DOI: 10.31857/S0132342322020105

Обзор посвящен изучению структуры, свойств и функций маннозных рецепторов альвеолярных макрофагов – перспективных мишеней для создания систем адресной доставки лекарственных средств, предназначенных для лечения заболевания дыхательных путей. В первом разделе обсуждается поиск оптимальной стратегии изучения лиганд-рецепторных взаимодействий и определения специфичности лигандов к маннозным рецепторам макрофагов с целью увеличения эффективности и органной биодоступности лекарственных препаратов. Рассмотрены модельные белки, которые используются для симуляции взаимодействий белок–лиганд в системах in vitro. Так, применение конканавалина А в качестве модельного маннозоспецифичного лектина дает возможность определять параметры связывания с лигандами различной структуры, проводить широкий скрининг массива лигандов, исследовать вклад стерических факторов при связывании лигандов, что затруднительно в случае сложной мишени – маннозного рецептора альвеолярных макрофагов (CD206), для которого в связи с его малой доступностью технически сложно создать адекватную скрининговую методику in vitro. Во втором разделе обзора представлены методы определения параметров связывания углеводсодержащих лигандов с рецепторами и модельными лектинами: ИК-спектроскопия, флуоресцентные методы, аффинная хроматография, конфокальная микроскопия, проточная цитометрия, рентгеноструктурный анализ, калориметрия. Проанализирован большой массив количественных параметров комплексообразования олигосахаридных лигандов с конканавалином А. Подбор оптимальной структуры лиганда варьированием плотности и количества маннозосодержащих лигандов, а также длины спейсера рассматривается как основа для создания систем адресной доставки. В третьем разделе обзора обсуждается практическое применение рассматриваемых подходов при создании и испытании систем адресной доставки биоактивных веществ в системах in vivo. Ключевые слова: альвеолярные макрофаги, маннозные рецепторы, CD206, спектральные методы, конканавалин А Биоорг. химия, Т. 48, с. 162–193 DOI: 10.31857/S0132342322010158

В обзоре приводятся данные об исследованиях пептидных гормонов и создании препаратов на их основе в исторической перспективе, за 100 лет, начиная с выделения и введения в медицинскую практику инсулина в 1921 г. Рассмотрены основные группы пептидных гормонов: нейрогипофизарные гормоны, гипоталамические рилизинг-гормоны, инкретины, а также инсулин, адренокортикотропный гормон (ACTH) и кальцитонин. Первые препараты пептидных гормонов созданы на основе традиционного подхода, включающего выделение пептидов из тканей животных, их очистку до индивидуальных соединений, установление первичной структуры, далее их химический синтез или глубокую очистку и создание фармацевтического препарата. Современный подход к созданию препаратов пептидных гормонов основан на рассмотрении их как лигандов соответствующих клеточных рецепторов и предполагает использование компьютерного моделирования, эффективных методов синтеза, высокопроизводительного скрининга, что дает возможность создания более активных, чем природные аналоги, соединений с заданным спектром активности, выходящим за рамки гормональной регуляции, устойчивых к биодеградации. Такие препараты созданы на основе аналогов соматостатина и люлиберина, агонистов и антагонистов, которые нашли широкое применение в качестве гормональных регуляторов и при лечении злокачественных новообразований. Два последних десятилетия проводились интенсивные исследования и разработка препаратов на основе глюкагон-подобного пептида (GLP-1), в обзоре показано, какие модификации привели к созданию наиболее “успешных” препаратов – высокоактивных, с длительным периодом полураспада. На фармацевтическом рынке широко представлены как препараты гормонов с природной структурой, так и их аналоги. Ключевые слова: пептидные гормоны, инсулин, адренокортикотропный гормон, рилизинг-гормоны, нейрогипофизарные гормоны, глюкагон-подобный пептид-1 Биоорг. химия, Т. 48, с. 194–206 DOI: 10.31857/S0132342322020154

Современные сведения о казеинах молока

С. Ю. Петрова, С. В. Хлгатян, О. Ю. Емельянова, Л. А. Пищулина, В. М. Бержец

Коровье молоко – один из наиболее частых триггеров пищевой аллергии у детей. Полагают, что главную роль в развитии клинических симптомов аллергических реакций у взрослых играют белки казеины, входящие в состав молока. К настоящему времени изучены основные физико-химические и иммунобиологические свойства казеинов и определена их первичная структура. Однако вопрос об особенностях структурной организации казеиновых мицелл коровьего молока до сих пор вызывает много научных споров. Расшифровка конформационной структуры казеинов, поиск новых IgE-связывающих эпитопов позволят выявить механизмы снижения аллергенной активности казеинов коровьего молока. Цель данного обзора – обобщить имеющиеся данные о структуре и свойствах казеиновых белков молока и определить их роль в формировании сенсибилизации к молочным продуктам. В обзоре описаны молекулярные характеристики, физико-химические свойства и иммунобиологические функции казеинов коровьего молока, а также изложены основные теоретические знания о структуре казеиновой мицеллы. Детально разобрана первичная структура различных типов казеинов: αs1-, αs2-, β- и κ-казеинов. Проведен сравнительный анализ содержания аминокислотных остатков в полипептидных цепях казеинов вышеуказанных типов. Выявлены участки гликозилирования, гидрофобные и гидрофильные области молекул. Проведена сравнительная характеристика основных казеинов женского грудного (β-казеин, κ-казеин) и коровьего молока. Затронуты актуальные вопросы аллергенной активности казеинов коровьего молока и их перекрестной реактивности с белками молока других видов млекопитающих. Дальнейшее изучение физико-химических и иммунобиологических свойств казеинов будет способствовать разработке различных стратегий снижения аллергических реакций, вызванных потреблением молока. Одни подходы будут направлены на изменение структуры аллергена методом технологической обработки молока, другие – на снижение чувствительности к аллергенам молока с помощью иммунотерапии. Ключевые слова: коровье молоко, грудное женское молоко, казеиновая мицелла, -казеин, -казеин, s1-казеин, s2-казеин Биоорг. химия, Т. 48, с. 207–216 DOI: 10.31857/S0132342322020178

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

Тканеспецифическая экспрессия изоформ нейрексина-1α в органах крысы

О. В. Серова, Е. А. Ганцова, И. Е. Деев, А. Г. Петренко

Нейрексины представляют собой семейство белков синаптической адгезии, которые играют ключевую роль в формировании и поддержании синапсов. Нейрексины подвергаются обширному альтернативному сплайсингу в шести сайтах (SS1–SS6), что приводит к экспрессии множества различных изоформ. Альтернативный сплайсинг регулирует функциональную активность нейрексинов в различных типах тканей и клеток и, предположительно, играет ключевую роль в определении специфичности взаимодействия различных нейронов. В этом исследовании мы провели анализ тканевой экспрессии изоформ мРНК нейрексина-1α, содержащих вставку в недавно обнаруженном сайте сплайсинга SS6, с использованием TaqMan ПЦР в реальном времени в различных органах крыс линии Wistar. Изоформа, содержащая вставку в сайте SS6, была обнаружена только в нейрональных тканях, что указывает на ее потенциальную функциональную важность. Положение вставки SS6 в шарнирной области между доменами LNS5 и LNS6 увеличивает вариабельность возможных конформаций молекулы, что может представлять собой дополнительный механизм регулирования функциональной активности нейрексина-1α в головном мозге. Ключевые слова: нейрексин, сайт сплайсинга, SS6, мозг, экспрессия генов Биоорг. химия, Т. 48, с. 217–222 DOI: 10.31857/S0132342322020191

Слаженная работа различных частей рибосомы в процессе синтеза белка предполагает наличие механизма, который координирует их действия, однако этот механизм до сих пор неизвестен. Роль такого механизма может играть транспорт носителей заряда (электронов или дырок) по молекулам рРНК и тРНК и локализация этих носителей заряда в функционально значимых областях рибосомы. В настоящей работе на основе расчетов методом теории функционала плотности показана возможность дырочного транспорта по центральному элементу малой субъединицы рибосомы – спирали h44. С помощью метода Монте-Карло выявлено, что дырки имеют тенденцию к локализации в определенных функционально значимых областях исследуемого фрагмента РНК, которые расположены вблизи декодирующего центра и межсубъединичных мостиков. На основании полученных данных предположено, что транспорт и локализация дырок в пределах спирали h44 координируют относительное движение субъединиц рибосомы с другими процессами, происходящими при трансляции. Ключевые слова: транспорт заряда, рибосома, аллостерия, теория функционала плотности Биоорг. химия, Т. 48, с. 223–231 DOI: 10.31857/S0132342322020221

Голотурия Eupentacta fraudatrix широко используется для изучения механизмов регенерации и выделения биологически активных веществ. Данные о содержании липидов и составе E. fraudatrix ограничиваются описанием состава жирных кислот (ЖК). Впервые были идентифицированы молекулярные виды запасных и структурных липидов кишечника E. fraudatrix различными методами хроматографии и масс-спектрометрии. Триацилглицерины как запасные липиды характеризуются высокой концентрацией трофических маркеров ЖК. Среди структурных липидов фосфатидилэтаноламины и фосфатидилхолины характеризуются высоким уровнем молекулярных видов с простой эфирной связью. Фосфатидилсерины (ФС) и фосфатидилинозитолы (ФИ) отличаются от других липидов преобладанием длинноцепочечных ЖК в составе, среди которых обнаружена кислота 23:1n-9, характерная для голотурий. Изучение липидома морских организмов может способствовать пониманию путей биосинтеза и распределения маркерных жирных кислот в липидах. Ключевые слова: голотурия, жирные кислоты, липидом, масс-спектрометрия Биоорг. химия, Т. 48, с. 232–239 DOI: 10.31857/S0132342322020087

Получение гуманизированного антитела 5D3Hu к опухолевому антигену PRAME

М. В. Ларина, Ю. П. Финашутина, Н. А. Лыжко, В. А. Мисюрин, В. Н. Новоселецкий, Д. А. Долгих, О. Н. Солопова, А. М. Мойсенович, Д. С. Балабашин, Т. К. Алиев, А. В. Мисюрин, М. П. Кирпичников

Антиген PRAME, представляющий собой значимую мишень для моноклональных антител, – это онкоспецифический маркер, который активен на всех стадиях дифференцировки опухолевых клеток и вызывает спонтанный T-клеточный ответ. В данной работе на основе моноклонального антитела 5D3 мыши к белку PRAME было сконструировано гуманизированное антитело 5D3Hu и наработано в клетках CHO (клетки опухоли яичников китайского хомячка). Показано, что гуманизированное антитело 5D3Hu обладает высокой аффинностью по отношению к антигену (1.4 нМ), связывается как с рекомбинантным, так и с нативным белком PRAME, а также оказывает ингибирующее действие на пролиферацию PRAME-положительных клеточных линий. Полученные результаты позволяют рассматривать мАТ 5D3Hu в качестве перспективного терапевтического средства для лечения онкологических заболеваний, при которых наблюдается гиперэкспрессия белка PRAME. Ключевые слова: PRAME, гуманизированные антитела, иммунотерапия опухолей Биоорг. химия, Т. 48, с. 240–252 DOI: 10.31857/S0132342322020130

3, 2022

2022

2022, том 48, номер 3

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

ОБЗОРНЫЕ СТАТЬИ

Углеводы – один из наиболее химически разнообразных классов биомакромолекул. Объем накопленной информации о них многократно превышает уровень, позволяющий ориентироваться в этом океане данных без специальных средств – баз данных (БД) гликомики и прогностических сервисов, использующих данные из этих баз. Существующие БД не полностью совместимы друг с другом как по покрытию, так и по форматам данных и возможностям, предоставляемым пользователям, и направлены на решение отдельных задач. Главные проблемы нынешних БД – наличие ошибок, пробелы в полноте покрытия и отсутствие общепризнанного углеводного языка. Наиболее востребованы углеводные БД с широким покрытием для обеспечения единого информационного пространства данных по структуре, свойствам и функциям углеводов, связанных с таксономией и свойствами их природных источников. В рамках проекта Carbohydrate Structure Database (CSDB) была создана архитектура БД, направленная на создание расширяемого проекта гликоинформатики с непрерывной поддержкой и регулярным обновлением данных. Она была реализована в программном продукте, лишенном основных недостатков других БД гликомики. За 15 лет своего существования CSDB стала основным источником данных по углеводам микроорганизмов и платформой для множества сервисов углеводной тематики. Проект нацелен на создание современной и всеобъемлющей базы природных углеводов со свободным доступом, ежегодным обновлением и дополнением содержимого, поиском и устранением ошибок (в том числе в публикациях), появлением новых сервисов. Ключевые слова: CSDB, углеводы, базы данных, гликоинформатика Биоорг. химия, Т. 48, с. 255–265 DOI: 10.31857/S0132342322030198

Антибиотики группы ауреоловой кислоты – митрамицин, хромомицин А3, оливомицин А – ароматические гликозилированные поликетиды, продуцируемые актиномицетами. Молекула ауреоловой кислоты состоит из трициклического агликона с двумя олигосахаридными цепями в качестве заместителей, а также пентильной боковой цепи в положении С3. Для митрамицина и хромомицина А3 детально исследованы механизм биосинтеза в штаммах-продуцентах, роль ферментов, необходимость каждого этапа биосинтеза и их влияние на биологическую активность продукта. Благодаря этому стал возможен рациональный поиск новых, более специфичных и менее токсичных аналогов существующих антибиотиков группы ауреоловой кислоты. В настоящем обзоре обобщены базовые и новейшие знания о биосинтезе ауреоловых антибиотиков, современных подходах к химическим и полусинтетическим модификациям, взаимосвязях “структура–активность”. Проанализированы молекулярные механизмы цитотоксичности ауреоловой кислоты и перспективы развития этого класса соединений как “кандидатов” в противоопухолевые препараты. Ключевые слова: антибиотики, митрамицин, оливомицин А, хромомицин А3, механизм действия, биосинтез, ДНК-лиганды Биоорг. химия, Т. 48, с. 266–278 DOI: 10.31857/S0132342322020129

Вирусная угроза может возникнуть неожиданно и где угодно, быстро перейти в стадию эпидемии или пандемии, и тогда потребуется в короткие сроки разработать эффективные средства терапии и профилактики. Разработка вакцины занимает десятилетия, а применение противовирусных соединений часто малоэффективно и небезопасно. Быстрым ответом может быть использование иммунных сывороток переболевших лиц, однако ряд сложностей, связанных с их использованием, заставил исследователей переключиться на разработку более безопасных и эффективных препаратов на основе моноклональных антител (мАТ). Для того чтобы обеспечить защиту, подобные препараты должны обладать ключевой характеристикой – нейтрализующими свойствами, т.е. способностью блокировать заражение клеток вирусом. В настоящее время в арсенале исследователей имеется ряд подходов для получения мАТ, однако ни один из них нельзя назвать эталоном, каждый подход имеет собственные достоинства и недостатки. Выбор того или иного метода зависит как от особенностей вируса, так и от временных и технических ограничений. В предлагаемом обзоре проведен сравнительный анализ современных методов получения нейтрализующих мАТ, описаны актуальные тенденции дизайна антител для терапии и профилактики вирусных заболеваний. Ключевые слова: моноклональные антитела, вирусные инфекции, гибридомная технология, дисплейные методы, сортировка В-клеток Биоорг. химия, Т. 48, с. 279–295 DOI: 10.31857/S0132342322020166

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

Синтез дисахарида Xylβ 1-2Manβ – корового фрагмента растительных N -гликопротеинов

С. В. Цыганкова, Г. В. Пазынина, А. С. Парамонов, А. О. Чижов, Н. В. Бовин

Впервые синтезирован дисахарид Xylβ1-2Manβ в виде спейсерного производного. Этот структурный фрагмент гликопротеиновых N-цепей типичен для растительной клетки и не встречается у млекопитающих. Предполагается, что у растений есть белки, специфически узнающие Xylβ1-2Manβ, поэтому молекулярные пробы на основе этого дисахарида представляют интерес для поиска, выделения и выяснения клеточной локализации соответствующих белков – лектинов и ферментов. Ключевые слова: синтез олигосахаридов, -маннозилирование, растительные N-гликаны Биоорг. химия, Т. 48, с. 296–301 DOI: 10.31857/S0132342322030204

Характеристика структуры и генов биосинтеза О-антигенов Azospirillum zeae N7(T), Azospirillum melinis TMCY 0552(T) и Azospirillum palustre B2(T)

Е. Н. Сигида, В. С. Гринёв, Э. Л. Здоровенко, А. С. Дмитренок, Г. Л. Бурыгин, Н. К. Кондюрина, С. А. Коннова, Ю. П. Федоненко

Впервые выделены и исследованы О-специфические полисахариды из липополисахаридов типовых штаммов трех видов бактерий: Azospirillum zeae N7, Azospirillum melinis TMCY 0552 и Azospirillum palustre B2. На основании результатов моносахаридного анализа, включающего определение абсолютной конфигурации моносахаридов, одномерной и двумерной спектроскопии 1 H- и 13C-ЯМР установлено, что выделенные полисахариды состоят из разветвленных тетрасахаридных повторяющихся звеньев следующей структуры: →3)-α-L-Rhap2OAc-(1→2)-[β-D-Glcp-(1→3)]-α-L-Rhap- (1→3)-α-L-Rhap-(1→, описанной ранее для ряда штаммов азоспирилл, отнесенных к серогруппе III. Функции генов, ответственных за биосинтез О-антигенов, определены путем сравнения с последовательностями, представленными в доступных базах данных; показан высокий уровень их гомологии. Ключевые слова: Azospirillum, липополисахарид, О-специфический полисахарид, структура бактериальных полисахаридов, кластер генов О-антигена Биоорг. химия, Т. 48, с. 302–312 DOI: 10.31857/S0132342322030174

Биосинтез растительной целлюлозы осуществляется мембранным комплексом изоферментов с участием ряда коферментов. Принято считать, что целлюлозосинтазные комплексы, синтезирующие первичную и вторичную клеточную стенку, различаются по составу изоферментов. Некоторые растительные волокна, включая флоэмные волокна льна и ксилемные волокна древесины натяжения тополя, формируют третичную клеточную стенку, которая характеризуется повышенным содержанием целлюлозы и пониженным содержанием ксилана и лигнина. Состав и типы целлюлозосинтазных комплексов, вовлеченных в биосинтез третичной клеточной стенки, до сих пор не установлены. Опираясь на транскриптомные данные для растений льна (Linum usitatissimum) и тополя (Populus alba × tremula), мы оценили экспрессию генов, кодирующих целлюлозосинтазы, в ходе развития гравитропической реакции с участием флоэмных и/или ксилемных волокон, формирующих третичную клеточную стенку. Изменения в экспрессии генов целлюлозосинтаз, характерных как для первичных, так и для вторичных клеточных стенок, в различных модельных системах свидетельствуют о подвижности ансамбля различных изоформ целлюлозосинтаз при реализации гравиответа, который может затрагивать как отдельный тип клеток, так и совокупность тканей с различными типами клеточных стенок. На выделенных флоэмных волокнах льна продемонстрирована вовлеченность целлюлозосинтаз обоих типов в формирование третичной клеточной стенки на всех стадиях гравиответа. Ключевые слова: целлюлозосинтазы, третичная клеточная стенка, растительные волокна, транскриптомный анализ Биоорг. химия, Т. 48, с. 313–327 DOI: 10.31857/S0132342322030137

Фармакологические свойства галогенидов 2-аминобензимидазолия и производных имидазо[1,2-а ]бензимидазола

А. А. Спасов, О. Н. Жуковская, Н. А. Гурова, Л. В. Науменко, Н. В. Елисеева, А. Ф. Кучерявенко, В. А. Косолапов, Д. С. Яковлев, В. Ю. Муравьева, В. А. Бабкова, Д. А. Бабков, Ю. В. Лифанова, А. С. Морковник

Исследована биологическая активность галогенидов 2-аминобензимидазолия и производных 9-замещенных 2-(4-фторфенил)имидазо[1,2-a]бензимидазолов in vitro. Среди производных аминобензимидазолия обнаружено соединение с NHE-1-ингибирующей активностью. Среди производных имидазобензимидазола найдены соединения, которые влияют на продолжительность рефрактерного периода предсердий крыс, агрегацию тромбоцитов, гемореологическую активность, подавляют образование конечных продуктов гликирования. У всех изученных соединений не выявлены DPP-4-ингибирующее, антиоксидантное действие, каппа-опиоидная агонистическая, 5-НТ2Аи 5-НТ3-антагонистическая активность. Ключевые слова: имидазо[1,2-a]бензимидазол, галогениды 2-аминобензимидазолия, NHE-1-ингибирующая активность, антиагрегантное действие, гемореологическая активность, антигликирующий эффект Биоорг. химия, Т. 48, с. 328–339 DOI: 10.31857/S0132342322020233

Ацильномодифицированные водорастворимые производные хитозана – носители для адсорбционной иммобилизации папаина

А. В. Сорокин, С. С. Ольшанникова, Н. В. Малыхина, Ф. А. Сакибаев, М. Г. Холявка, М. С. Лавлинская, В. Г. Артюхов

Кислотным гидролизом в 0.1 М водном растворе соляной кислоты получены образцы хитозана с различными величинами молекулярных масс – 350 и 200 кДа, определенными вискозиметрическим методом. Из полученных образцов синтезированы целевые производные N-сукциноилхитозана и N-малеоилхитозана, структура которых подтверждена методом ИК-спектроскопии, а степени замещения рассчитаны на основе титриметрических данных. Осуществлена адсорбционная иммобилизация папаина на хитозане и его производных. Оптимальное соотношение содержания белка (мг/г носителя), общей активности (ед./мл раствора) и удельной активности (ед./мг белка) выявлено при иммобилизации папаина на матрице хитозана и N-сукциноилхитозана с молекулярной массой 200 кДа. Ключевые слова: N-сукциноилхитозан, N-малеоилхитозан, папаин Биоорг. химия, Т. 48, с. 340–351 DOI: 10.31857/S013234232202021X

Реакцией брассиностероидов с ангидридом янтарной кислоты в присутствии диметиламинопиридина впервые получены производные 24-эпибрассинолида и 24-эпикастастерона с янтарной кислотой в виде тетрагемисукцинатов. В лабораторных опытах установлено, что полученные соединения оказывают заметное влияние на посевные качества семян и рост проростков ярового ячменя. Действие тетрагемисукцинатов в ряде тестов превосходило росторегулирующие эффекты соответствующих брассиностероидов, янтарной кислоты и смеси этих фитогормонов. Ключевые слова: брассиностероиды, янтарная кислота, синтез тетрагемисукцинатов брассиностероидов, ростостимулирующее действие Биоорг. химия, Т. 48, с. 352–356 DOI: 10.31857/S0132342322030125

Синтез и исследование антидепрессивных свойств новых аналогов аргинин-вазопрессина

К. В. Бородина, О. Н. Саванец, Е. С. Пустюльга, В. П. Мартинович, Е. В. Кравченко, Л. М. Ольгомец, В. П. Голубович

С целью поиска новых аналогов аргинин-вазопрессина (АВП), обладающих антидепрессивными свойствами, было осуществлено компьютерное моделирование, которое позволило выявить ряд пептидных аналогов С-концевого фрагмента АВП: N-Ac-D-Ser-Pro-D-Arg-Gly-NH2, N-Ac-Phe-ProArg-Gly-NH2, N-Ac-Trp-Pro-Arg-Gly-NH2. В работе представлены методики синтеза смоделированных соединений. C использованием теста принудительного плавания для выявления соединений, потенциально обладающих антидепрессивной активностью, было показано, что при интраназальном введении крысам-самцам линии Wistar исследуемых пептидов в дозах 0.1–10.0 мкг/кг наибольшим сходством по ряду изученных показателей с референтным антидепрессантом флуоксетином обладают N-Ac-TrpPro-Arg-Gly-NH2 (0.1, 1.0 и 10.0 мкг/кг) и N-Ac-D-Ser-Pro-D-Arg-Gly-NH2 (1.0 мкг/кг). Ключевые слова: пептиды, аргинин-вазопрессин, компьютерное моделирование, интраназальное введение, депрессия, крысы Биоорг. химия, Т. 48, с. 357–370 DOI: 10.31857/S0132342322030058

Электроподвижный белок престин как чувствительное ядро флуоресцентного индикатора мембранного потенциала

Л. А. Кост, В. А. Юнусова, В. О. Иванова, Е. С. Никитин, К. А. Лукьянов, А. М. Богданов

В настоящей работе мы впервые применили престин – электроподвижный белок слухового анализатора млекопитающих – в качестве потенциал-чувствительного ядра генетически кодируемого индикатора мембранного потенциала. Prestin-5 – один из вариантов химерного белка, полученного нами путем слияния полипептидных цепей престина и флуоресцентного репортера FusionRed, – при электрофизиологическом тестировании продемонстрировал флуоресцентный ответ на изменение мембранного потенциала, характеризующийся субмиллисекундной кинетикой. Таким образом, мы показали работоспособность престина в составе флуоресцентных потенциал-чувствительных конструкций. Ключевые слова: индикатор мембранного потенциала, флуоресцентный биосенсор, нейробиология, флуоресцентные белки, престин Биоорг. химия, Т. 48, с. 371–374 DOI: 10.31857/S0132342322030095

Синтезированы новые производные хромофора белка Kaede – (Z)-2-(4-метоксибензилиден)-6/8- фенилимидазо[1,2-a]пиридин-3(2H)-оны. Установлено, что положение фенильного заместителя в имидазопиридиноновом фрагменте не влияет на оптические свойства подобных соединений. Ключевые слова: имидазолоны, хромофоры, флуоресцентный белок Kaede, флуоресценция Биоорг. химия, Т. 48, с. 375–378 DOI: 10.31857/S0132342322030149

5-2022
4-2022
6-2022

2022, том 48, номер 4

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

АТР-зависимые Lon-протеазы в системе контроля качества клеточных белков (обзорная статья)

А. М. Куджаев, А. Г. Андрианова, А. Е. Гущина, И. В. Смирнов, Т. В. Ротанова (с. 381–414)

Флуоресцентные зонды для обнаружения хлорноватистой кислоты в живых клетках (обзорная статья)

В. Е. Реут, И. В. Горудко, Д. В. Григорьева, А. В. Соколов, О. М. Панасенко (с. 415–441)

Влияние состава липидной матрицы на микроокружение левофлоксацина в липосомальных формах

И. М. Ле-Дейген, А. С. Сафронова, И. М. Колмогоров, А. А. Скуредина, Е. В. Кудряшова (с. 442–452)

Влияние липидных компонентов на иммуногенность синтетического фрагмента антигена NS4A вируса гепатита С

А. Н. Белявцев, Н. С. Шастина, В. В. Куприянов, Л. И. Николаева, М. В. Мельникова, Е. Ф. Колесанова, М. Ю. Шимчишина, И. В. Капустин (с. 453–460)

Биологически активный фрагмент рецептора конечных продуктов гликирования (RAGE) способен ингибировать олигомеризацию бета-амилоида

Т. Д. Волкова, А. В. Аветисян, Д. О. Короев, А. В. Камынина, С. М. Баласанянц, Р. А. Симонян, О. М. Вольпина (с. 461–469)

Окислительная модификация и протеолиз белков печени садковой радужной форели при воздействии средовых факторов

Н. П. Канцерова, Е. Д. Тушина, И. В. Суховская, Л. А. Лысенко (с. 470–478)

Нитроазолопиримидины: влияние на аденозиновый рецептор А1 и внутриглазное давление у крыс

К. В. Саватеев, В. Л. Русинов, С. К. Котовская, А. А. Спасов, Л. В. Науменко, А. С. Таран, А. А. Бригадирова, Д. С. Яковлев, К. Т. Султанова, Н. М. Щербакова (с. 479–485)

Новые гибридные молекулы на основе серосодержащих никотинонитрилов: синтез, анальгетическая активность in vivo в тесте уксуснокислых корчей и молекулярный докинг

Д. С. Кривоколыско, В. В. Доценко, Е. Ю. Бибик, А. А. Самокиш, Ю. С. Венидиктова, К. А. Фролов, С. Г. Кривоколыско, А. А. Панков, Н. А. Аксенов, И. В. Аксенова (с. 486–494)

Цианиновые красители в качестве флуорогенов для белков FAST и nanoFAST (письмо редактору)

А. А. Хрулев, Н. С. Балеева, П. Н. Камзеева, М. С. Баранов, А. В. Аралов (с. 495–499)

Циркулярные пермутанты белка BrUSLEE как флуоресцентные индикаторы pН (письмо редактору)

А. В. Мамонтова, Т. Р. Симонян, К. А. Лукьянов, А. М. Богданов (с. 500–504)

2022, том 48, номер 5

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry” , ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

Академик РАН Иванов Вадим Тихонович (18.09.1937–08.04.2022) (c. 507)

Метаболизм гиалуроновой кислоты и прогрессия опухолей (обзорная статья)

И.И. Хегай (c. 508–519)

Роль линкерных гистонов в канцерогенезе (обзорная статья)

А.В. Любителев, М.П. Кирпичников, В.М. Студитский (c. 520–530)

Влияние структуры липидного фрагмента на встраивание и выход гликолипидов из клеток: изучение с помощью синтетических аналогов

Е.В. Сливка, А.Б. Тузиков, С.В. Хайдуков, В.А. Комарова, С. Генри, Н.В. Бовин, Е.М. Рапопорт (c. 531–536)

Синтетические антимикробные пептиды. IV. Влияние катионных групп лизина, аргинина и гистидина на антимикробную активность пептидов с “круговым” типом амфипатичности

Н.В. Амирханов, А.В. Бардашева, Н.В. Тикунова, Д.В. Пышный (c. 537–550)

Методика радиолигандного анализа для одновременного определения содержания β1- и β2-адренорецепторов в клетках крови человека

А.Я. Шевелев, Н.М. Каширина, Л.Н. Липатова, Е.В. Янушевская, М.М. Пекло, И.Н. Рыбалкин, П.Н. Руткевич, О.К. Чусовитина, Н.А. Скоблова, Ю.С. Скоблов, Т.Н. Власик, К.А. Зыков (c. 551–560)

Синтез и оценка биологической активности антагониста рецептора галанина GalR2 при ишемии и реперфузии сердца крыс in vivo

М.В. Сидорова, М.Е. Палькеева, Д.В. Авдеев, И.М. Студнева, Л.И. Серебрякова, О.М. Веселова, И.В. Доброхотов, А.С. Молокоедов, О.И. Писаренко (c. 561–568)

Синтез и исследование противовоспалительной активности новых производных пиримидина – ингибиторов изоформ циклооксигеназ

Ю.З. Хазимуллина, А.Р. Гимадиева, В.Р. Хайруллина, Л.Ф. Зайнуллина, Ю.В. Вахитова, А.Г. Мустафин (c. 569–579)

Новый подход к синтезу фотоблокированных малых интерферирующих РНК для активируемой светом РНК-интерференции

Е.А. Ахметова, Д.В. Ким, А.С. Доме, М.И. Мещанинова, Д.С. Новопашина (c. 580–588)

Детекция вируса блютанга с помощью микросфер, конъюгированных с моноклональными антителами к групп-специфичному белку (VP7), методом проточной вирометрии

Н.В. Руденко, А.П. Каратовская, А.В. Замятина, А.С. Малоголовкин, В.А. Олейников, Ф.А. Бровко, А.Ю. Кольцов, О.Г. Лаптева, Д.В. Колбасов, А.О. Шепеляковская (c. 589–598)

Биочип с агарозными микроячейками, содержащими термоотщепляемые праймеры (письмо редактору)

А.М. Золотов, Р.А. Мифтахов, А.Ю. Иконникова, С.А. Лапа, В.Е. Кузнецова, В.А. Василисков, В.Е. Шершов, А.С. Заседателев, Т.В. Наседкина, А.В. Чудинов (c. 599–605)

Влияние ингибиторов миозина на экспрессию механозависимых генов в раннем развитии шпорцевой лягушки (письмо редактору)

П.А. Филенко, А.А. Чеченина, А.Г. Зарайский, Ф.М. Ерошкин (c. 606–610)

Синтез и оптические свойства конформационно зафиксированного диарилметенового аналога хромофора белка GFP (письмо редактору)

Н.С. Балеева, А.Ю. Смирнов, М.С. Баранов (c. 611–615)

Галогенсодержащие 4-гидроксибензилиден-роданины как флуорогены для белка FAST (письмо редактору)

А.И. Соколов, Н.С. Балеева, М.С. Баранов (c. 616–620)

Правила для авторов журнала “Биоорганическая химия” 2022–2023 (c. 621–630)

2022, том 48, номер 6

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”,​ ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

Перспективы использования сульфатированных полисахаридов с высоким содержанием фукозы из морских организмов в лечении и профилактике COVID-19 и постковидного синдрома (обзорная статья)

М. В. Киселевский, Н. Ю Анисимова, М. И. Билан, А. И. Усов, Н. Е. Устюжанина, А. А. Петкевич, И. Ж. Шубина, Г. Е. Морозевич, Н. Э. Нифантьев (с. 633–647)

Синтез и биологическая активность N-ацилгидразонов (обзорная статья)

Э. Р. Беляева, Ю. В. Мясоедова, Н. М. Ишмуратова, Г. Ю. Ишмуратов (с. 648–676)

Петлевая изотермическая амплификация: от теории к практике (обзорная статья)

Ф. В. Ширшиков, Ю. А. Беспятых (с. 677–693)

Взаимодействие фторфенильного аналога ретиналя с протеородопсином из Exiguobacterium sibiricum

Н. Е. Беликов, Л. Е. Петровская, Е. А. Крюкова, Д. А. Долгих, Е. П. Лукашев, А. Ю. Лукин, О. В. Демина, С. Д. Варфоломеев, В. В. Чупин, А. А. Ходонов (с. 694–706)

Cинтез 2-метилиден-спермидина и его N1-ацетильного производного

М. А. Хомутов, А. Р. Хомутов (с. 707–713)

Рибофлавин как один из возможных компонентов биолюминесцентной системы грибных комаров рода Keroplatus (Insecta: Diptera: Keroplatidae)

А. А. Котлобай, М. А. Дубинный, А. В. Полевой, С. И. Ковальчук, З. М. Каськова (с. 714–720)

Поиск опухолеспецифических промоторов in silico

К. Н. Кашкин (с. 721–731)

Расчеты свободной энергии взаимодействия широкоспецифичной пиримидиннуклеозидфосфорилазы с потенциальными ингибиторами

П. А. Эйстрих-Геллер, С. В. Рубинский, В. Р. Самыгина, А. А. Лашков (с. 732–744)

Циклооктатетраен как фотостабилизатор флуорогена белка FAST (письмо редактору)

А. И. Соколов, А. А. Горшкова, Н. С. Балеева, М. С. Баранов (с. 745–750)

Кетопроизводные арилиден-имидазолонов как флуорогенные красители (письмо редактору)

А. И. Соколов, А. А. Горшкова, Н. С. Балеева, М. С. Баранов (с. 751–756)

1-2023
2-2023
3-2023

2023

2023, том 49, номер 1

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

Мускариновые и никотиновые холинорецепторы в регуляции сердечно-сосудистой системы (обзорная статья)

А. В. Осипов, А. С. Аверин, Э. Р. Шайхутдинова, И. А. Дьяченко, В. И. Цетлин, Ю. Н. Уткин (с. 3–22)

Белки холодового шока бактерий как инструмент адаптации к стрессу (обзорная статья)

А. С. Григоров, Т. Л. Ажикина (с. 23–31)

Перспективы использования катионов металлов для разработки противомикробных комплексов (обзорная статья)

А. В. Кадомцева, Г. М. Мочалов, И. В. Жданович, М. С. Пискунова (с. 32–40)

Противовоспалительное действие синтетического пептида LKEKK (обзорная статья)

Е. В. Наволоцкая, Д. В. Зинченко, А. Н. Мурашев (с. 41–47)

Липосомы с набором Т-клеточных эпитопов вируса SARS-CoV-2 как прототип вакцинной конструкции

Д. С. Третьякова, А. С. Алексеева, Н. Р. Онищенко, И. А. Болдырев, Н. С. Егорова, Д. В. Васина, В. А. Гущин, А. С. Чернов, Г. Б. Телегин, В. А. Казаков, К. С. Плохих, М. В. Коновалова, Е. В. Свирщевская, Е. Л. Водовозова (с. 48–64)

Полимеры 2,5-дигидроксибензойной кислоты индуцируют образование сфероидов клеток млекопитающих

Г. К. Рысцов, А. В. Лисов, М. Ю. Земскова (с. 65–78)

Экспериментальная оценка 3-мета-пиридин-1,2,4-оксадиазольного производного дезоксихолевой кислоты как прототипа ингибиторов 5-α-редуктазы в моделях in silico и in vivo

Ю. В. Мешкова, Д. С. Баев, И. В. Сорокина, И. И. Попадюк, О. В. Саломатина, Н. А. Жукова, Т. Г. Толстикова, Н. Ф. Салахутдинов (с. 79–92)

Получение комплексов фицина с карбоксиметилхитозаном и N-(2-гидрокси)пропил-3-триметиламмонийхитозаном и изучение их структурных особенностей

Н. В. Малыхина, С. С. Ольшанникова, М. Г. Холявка, А. В. Сорокин, М. С. Лавлинская, В. Г. Артюхов, Д. А. Файзуллин, Ю. Ф. Зуев (с. 93–104)

Правила для авторов журнала “Биоорганическая химия” 2023 (с. 105–110)

2023, том 49, номер 2

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

Как меняются общепринятые подходы к применению полимерсодержащих композитов в молекулярной диагностике (обзорная статья)

Д. В. Капустин (с. 113–133)

Платформа мРНК-вакцин: особенности получения и доставки мРНК (обзорная статья)

В. Р. Литвинова, А. П. Рудомётов, Л. И. Карпенко, А. А. Ильичёв (с. 134–152)

Синтез и биологическая активность эфиров на основе циклоалкендикарбоновых кислот

А. А. Фирстова, Е. Р. Кофанов, М. И. Ковалева (с. 153–164)

Синтез и трансфицирующая активность дисульфидных поликатионных амфифилов

И. А. Петухов, П. А. Пучков, Н. Г. Морозова, М. А. Зенкова, М. А. Маслов (с. 165–177)

Гибридные органоминеральные носители для терапевтических белков

П. В. Зеленихин, А. Г. Галеева, Р. Р. Исламова, О. Н. Лопатин, Р. С. Яруллин, О. Н. Ильинская (с. 178–187)

Дизайн, синтез и изучение анксиолитической активности новых пирроло[1,2-a]пиразин-содержащих лигандов TSPO

Г. В. Мокров, А. С. Пантилеев, М. А. Яркова, И. В. Рыбина, Т. А. Гудашева, Ю. В. Вахитова, С. Б. Середенин (с. 188–206)

Влияние гуанидиновых производных хиназолина на Na+/H+-обменник и внутриглазное давление у крыс

А. С. Таран, Л. В. Науменко, Ю. А. Говорова, Н. А. Гурова, А. А. Спасов, А. А. Озеров, Д. В. Мережкина (с. 207–215)

Способ получения ионизируемого липида ALC-0315 – ключевого компонента липидной матрицы мРНК-вакцины (письмо редактору)

И. А. Болдырев, В. П. Шендриков, А. Г. Вострова, Е. Л. Водовозова (с. 216–220)

2023, том 49, номер 3

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

Предисловие к специальным номерам журнала, посвященным памяти академика РАН Вадима Тихоновича Иванова (c. 223)

От пептидов к рецепторам (обзорная статья)

В. И. Цетлин (c. 224–228)

Эволюция биофармацевтики пептидных препаратов (обзорная статья)

В. Т. Иванов, В. И. Дейгин (c. 229–242)

Терапевтический потенциал и перспективы применения антимикробных пептидов в эпоху глобального распространения антибиотикорезистентности (обзорная статья)

В. Н. Сафронова, И. А. Болосов, П. В. Пантелеев, С. В. Баландин, Т. В. Овчинникова (c. 243–258)

Многофункциональные белки и их роль в жизнедеятельности клеток (обзорная статья)

Д. А. Коршунов, Е. Е. Середа, И. В. Кондакова (c. 259–274)

Анализ времен жизни флуоресценции модельных соединений как подход к фотофизической инженерии флуоресцентных белков

Н. С. Балеева, М. С. Баранов, А. М. Богданов (c. 275–284)

Пространственная структура комплекса Fab-фрагмента моноклонального антитела LNKB-2 с антигенным нонапептидом интерлейкина-2 человека

Е. А. Горячева, И. В. Артемьев, Н. В. Плетнева, В. З. Плетнев (c. 285–290)

Удобный метод получения трет-бутиловых эфиров Nα-защищенных аминокислот из трет-бутанола

В. Н. Азев, А. Н. Чулин, М. В. Молчанов, А. И. Мирошников (c. 291–295)

Новый пептид из яда мадагаскарской кошачьеглазой змеи Madagascarophis colubrinus блокирует никотиновый холинорецептор

Е. В. Крюкова, Д. А. Иванов, Н. В. Копылова, В. Г. Старков, Т. В. Андреева, И. А. Иванов, В. И. Цетлин, Ю. Н. Уткин (c. 296–305)

Oсoбeннoсти кoмплeксoв самоорганизующихся пeптидoв H-(RADA)4-OH со слoями в syn- и anti-ориентации

А. В. Данилкович, Д. А. Тихонов, В. М. Липкин (c. 306–318)

Разработка системы биосинтеза, выделения и очистки холоформы рекомбинантного нейроглобина и его физико-химическая характеристика

М. А. Семенова, Ж. В. Бочкова, О. М. Смирнова, А. А. Игнатова, Е. Ю. Паршина, Р. Х. Зиганшин, Э. В. Бочаров, Н. А. Браже, Г. В. Максимов, М. П. Кирпичников, Д. А. Долгих, Р. В. Черткова (c. 319–330)

2023, том 49, номер 4

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

Методы анализа интерактома микробелков, кодируемых короткими открытыми рамками считывания (обзорная статья)

И.А. Седлов, И.А. Фесенко (с. 333–347)

Структурно-функциональные особенности кетозо-3-эпимераз и их использование для производства
D-аллюлозы
(обзорная статья)

Н.С. Иванова, А.А. Кульминская, С.В. Швецова (с. 348–359)

Роль RIG-I-подобных рецепторов в активации врожденного иммунитета при туберкулезе (обзорная статья)

Ю.В. Скворцова, О.С. Быченко, Т.Л. Ажикина (с. 360–368)

Теоретическое обоснование и формирование экспериментальных подходов к изменению структуры гиалуронидазы на основе ее вычислительного взаимодействия с короткоцепочечными гликозаминогликановыми лигандами (обзорная статья)

А.В. Максименко, Р.Ш. Бибилашвили (с. 369–383)

Внеклеточный белок холодового шока YB-1 индуцирует толерантность к GMDP и LPS в клеточной линии макрофагов мыши J774

Л.Г. Алексеева, А.Г. Ламан, Е.А. Мещерякова, А.О. Шепеляковская, Ф.А. Бровко, В.Т. Иванов (с. 384–391)

Строение сульфатированных полисахаридов из морского огурца Holothuria (Stauropora) fuscocinerea

М.И. Билан, А.С. Дмитренок, С.П. Никогосова, Е.А. Цветкова, Н.Е. Устюжанина, Cao Thi Thuy Hang, Pham Duc Thinh, Dinh Thanh Trung, Tran Thi Thanh Van, А.И. Усов, Н.Э. Нифантьев (с. 392–402)

Рекомбинантный SLURP-1 ингибирует рост и миграцию глиомы U251 MG в результате ареста клеточного цикла и модуляции сигнальных путей MAPK и AKT

М.А. Шулепко, М.Л. Бычков, М.П. Кирпичников , Е.Н. Люкманова (с. 403–410)

Региоспецифичный метод синтеза защищенного производного β-разветвленного дипептида аспарагиновой кислоты

В.Н. Азев, Л.К. Байдакова, А.Н. Чулин, А.Б. Тузиков, П.Г. Кислицин, М.В. Молчанов, А.И. Мирошников (с. 411–421)

Получение синтетических аналогов гликолипидов, содержащих тетрасахарид А (тип 2)

Д.О. Петракова, М.С. Савченко, И.С. Попова, А.Б. Тузиков, А.С. Парамонов, А.О. Чижов, Н.В. Бовин, И.М. Рыжов (с. 422–433)

Синтез липосом, конъюгированных с CpG-олигонуклеотидом и нагруженных набором Т-клеточных эпитопов вируса SARS-CoV-2 (письмо редактору)

Д.С. Третьякова, Т.Л. Ажикина, И.А. Болдырев, Е.В. Свирщевская, Е.Л. Водовозова (с. 434–440)

2023, том 49, номер 5

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

Конденсаты нуклеопротеина SARS-CoV-2 на вирусной РНК и их низкомолекулярные модуляторы (обзорная статья)

Ю. И. Светлова, Ю. И. Павлова, А. В. Аралов, А. М. Варижук (с. 443–454)

Аминокислотные производные фуллерена С60: синтез и биомедицинское применение (обзорная статья)

О. В. Ямскова, Д. В. Курилов, В. А. Волков, М. В. Воронков, И. В. Заварзин (с. 455–487)

Динамика изменений запасных липидов при восстановлении частично обесцвеченного коралла Sinularia heterospiculata

Т. В. Сикорская, Д. Д. Солодий, Е. В. Маськин (с. 488–493)

Новый комплекс рибозима с глюкозо-6-фосфатизомеразной активностью и фермента гексокиназы в пекарских дрожжах Saccharomyces cerevisiae

О. Н. Соловьева (с. 494–501)

Белковый профиль и аллергенные свойства тропомиозина и других аллергокомпонентов в составе водно-солевого экстракта гигантской тигровой креветки (Penaeus monodon)

В. М. Бержец, Г. И. Алаторцева, Л. Н. Нестеренко, С. В. Хлгатян, С. Ю. Петрова, Н. С. Петрова,  А. В. Васильева, Л. А. Пищулина, О. Ю. Емельянова (с. 502–508)

Синтетические трансформации высших терпеноидов. 42. Синтез новых производных 18-нор-4-(карбоксиэтил)изопимара-7,15-диена и изучение их цитотоксичности на линиях опухолевых клеток MCF7, U-87 MG и DU 145

М. А. Громова, Ю. В. Харитонов, Т. В. Рыбалова, В. А. Ларионов, Т. С. Голубева, Э. Э. Шульц (с. 509–522)

Индукция активности антиоксидантной системы соединениями селена в мицелии Aspergillus niger

П. А. Полубояринов, А. В. Кузнецова, И. Я. Моисеева, Н. И. Микуляк, А. П. Каплун (с. 523–536)

Биологический микрочип для определения соматических мутаций в генах изоцитратдегидрогеназ 1 и 2 (письмо редактору)

В. О. Варачев, Д. А. Гуськов, А. П. Шехтман, Д. В. Рогожин, С. А. Поляков, А. В. Чудинов, А. С. Заседателев, Т. В. Наседкина (с. 537–542)

Видовая идентификация коронавируса SARS-CoV-2 по консервативному участку Е-гена (письмо редактору)

С. А. Лапа, А. А. Шингарева, Е. Б. Файзулоев, Ю. И. Аммур, В. Е. Шершов, А. В. Чудинов (с. 543–547)

Альтернативные центры связывания хромофора в нековалентных флуоресцентных комплексах бактериального липокалина (письмо редактору)

Е. А. Горячева, И. В. Артемьев, С. Ф. Архипова, А. В. Россохин, А. Р. Гильванов, В. З. Плетнев, Н. В. Плетнева (с. 548–552)

2023, том 49, номер 6

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

Механизмы адаптации бактерий к стрессовым условиям посредством малых некодирующих РНК (обзорная статья)

А. С. Карпов, Д. А. Елкина, Т. С. Орецкая, Е. А. Кубарева (с. 555–574)

Радиофармацевтические препараты для диагностики злокачественных новообразований, неспецифичных к глюкозе (обзорная статья)

Е. Д. Белицкая, В. А. Димитрева, А. Н. Козлов, В. А. Олейников, А. В. Залыгин (с. 575–590)

Терапевтические нуклеиновые кислоты против вирусов простого герпеса (обзорная статья)

А. С. Левина, М. Н. Репкова, В. Ф. Зарытова (с. 591–610)

Химический состав молока человека и млекопитающих (обзорная статья)

Ш. Ф. Каримова, Г. О. Исмаилова (с. 611–626)

ТБ-ИЗАТЕСТ: способ дифференциальной диагностики Mycobacterium tuberculosis методом LAMP

Ф. В. Ширшиков, Ю. А. Беспятых (с. 627–640)

Биочип с ячейками из щеточных полимеров с реактивными карбоксильными группами для анализа ДНК

Р. А. Мифтахов, А. Ю. Иконникова, В. А. Василисков, С. А. Лапа, А. И. Левашова, В. Е. Кузнецова, В. Е. Шершов, А. С. Заседателев, Т. В. Наседкина, А. В. Чудинов (с. 641–648)

Синтез флуоресцентно-меченых нуклеотидов для маркирования продуктов изотермической амплификации

В. Е. Шершов, С. А. Лапа, А. И. Левашова, И. Ю. Шишкин, Г. Ф. Штылев, Е. Ю. Шекалова, В. А. Василисков, А. С. Заседателев, В. Е. Кузнецова, А. В. Чудинов (с. 649–656)

Синтез и оценка противовирусной активности 5-галоген-2'-азидопроизводных цитидина и N-гидроксицитидина на панели РНК-вирусов, включая SARS-CoV-2

П. Н. Камзеева, Е. С. Колпакова, Е. В. Карпова, М. О. Бородулина, Е. В. Яковчук, В. А. Алферова, А. А. Чистов, Е. С. Беляев, Л. И. Козловская, А. В. Аралов (с. 657–664)

Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 2023 (Supplement Issue) Open access

5-Alkyloxymethyl Derivatives of 2ʹ-Deoxyuridine Bearing 2,4-Dinitrophenyl and Dansyl Groups: Synthesis and Antibacterial Activity

D. A. Makarov, I. A. Oskolsky, M. V. Jasko, P. N. Solyev, B. F. Vasilyeva, M. V. Demiankova, O. V. Efremenkova,
S. N. Kochetkov, and L. A. Alexandrova (S1–S7)

4-2023
5-2023
6-2023
24-1
2024

2024

 

ЖУРНАЛУ 50 ЛЕТ

2024, том 50, номер 1

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

Новый подход к получению аналога КЭП-структуры с правильной ориентацией (Anti-Reverse Cap Analog, ARCA) 2mGpppG

А. Л. Каюшин, К. В. Антонов, Е. В. Дорофеева, М. Я. Берзина, А. О. Арнаутова, И. А. Прохоренко, А. И. Мирошников, И. Д. Константинова (с.3–10)

Поверхностно-активные вещества как средства доставки репортерной генетической конструкции на основе суицидного гена биназы в опухолевые клетки

Е. В. Дудкина, Э. А. Васильева, В. В. Ульянова, Л. Я. Захарова, О. Н. Ильинская (с. 11–25)

Участие транскрипционного фактора Сreb1 в регуляции работы гена mdh2, кодирующего малатдегидрогеназу, в печени крыс при аллоксановом диабете

А. Т. Епринцев, К. Р. Романенко, Н. В. Селиванова (с. 26–36)

Характеристики и определение острой токсичности водорастворимых полисахаридов из базидиального гриба
Ganoderma lucidum

С. Б. Хайтметова, А. С. Тураев, Г. А. Халилова, Б. И. Мухитдинов (с. 37–50)

Синтез стероидных трейсеров методом оксимного лигирования и их использование в поляризационном флуоресцентном иммуноанализе

И. А. Прохоренко, Д. А. Глущенко, Е. Л. Гуляк, И. В. Михура, В. А. Коршун, Л. И. Мухаметова,
С. А. Еремин (с. 51–64)

Аминокумараноны как хемилюминесцентные индикаторы активности уреазы и перекиси водорода

А. Ю. Смирнов, Н. С. Балеева, А. С. Мишин, Ю. А. Богданова, М. С. Баранов (с. 65–76)

Флуорогенные красители белка NanoLuc на основе арилиден-имидазолонов

Э. Р. Зайцева, Ю. А. Богданова, Н. С. Балеева, А. Ю. Смирнов, М. С. Баранов (с. 77–86)

2,5-Диметоксибензилиденроданин и его ациклические аналоги как селективные флуорогенные красители липидных капель живых клеток

С. А. Краснова, Ю. А. Богданова, А. И. Соколов, И. Н. Мяснянко, А. Ю. Смирнов, М. С. Баранов (с. 87–97)

24-2

ЖУРНАЛУ 50 ЛЕТ

2024, том 50, номер 2

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

Гибридное антимикробное покрытие на основе конъюгата гиалуроновой кислоты и пептида LL-37 дляПЭO-модифицированных титановых имплантатов

Л. В. Парфенова, З. Р. Галимшина, Г. У. Гильфанова, Э. И. Алибаева, Т. М. Пашкова, О. Л. Карташова,Р. Г. Фаррахов, В. Р. Аубакирова, Е. В. Парфенов (с. 101–110)

 

Наночастицы на основе полиферуловых и полигентизиновых кислот как новые носители противоопухолевых препаратов

И. В. Смирнов, А. В. Лисов, А. С. Казаков, А. Н. Звонарев, Н. Е. Сузина, М. Ю. Земсковa (с. 111–129)

 

Хлор-5,9-диеновые и другие жирные кислоты из морской губки Penares sp.  (Дополнительные материалы)

Е. А. Санталова, С. А. Колесникова (с. 130–145)

 

Протеиназная устойчивость карнозина, пирролилкарнозина и салицилкарнозина

К. В. Шевченко , И. Ю. Нагаев, О. И. Куликова, С. Л. Стволинский, В. П. Шевченко, Н. Ф. Мясоедов (с. 146–152)

 

Антимикробные метаболиты из назальной микробиоты свиней  (Дополнительные материалы)

А. А. Баранова, Ю. В. Закалюкина, А. П. Тюрин, В. А. Коршун, О. А. Белозерова, М. В. Бирюков, А. В. Моисеенко,
С. С. Терехов, В. А. Алферова (с. 153–174)

 

Синтез и гипогликемическое действие новых никотинонитрил-фурановых молекулярных гибридов

Д. А. Тильченко, Е. Ю. Бибик, В. В. Доценко, С. Г. Кривоколыско, К. А. Фролов,Н. А. Аксенов, И. В. Аксенова (с. 175–192)

 

Арилиден-имидазолоны и их ациклический аналог как флуоресцентные сенсоры ионов металлов  (Дополнительные материалы)

С. А. Краснова, Э. Р. Зайцева, Д. И. Рудик, Д. С. Иванов, А. А. Михайлов, М. С. Баранов (с. 193–200)

ЖУРНАЛУ 50 ЛЕТ

Специальный номер, посвященный 90-летию со дня рождения основателя журнала академика РАН
Юрия Анатольевича Овчинникова

2024, том 50, номер 3

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

Предисловие к специальным номерам, посвященным 90-летию со дня рождения основателя журнала академика РАН Юрия Анатольевича Овчинникова (с. 201–202)

Новый BRICHOS-ассоциированный дефенсин-подобный антимикробный пептид из морской полихеты Arenicola marina

В. Н. Сафронова, П. В. Пантелеев, Р. Н. Кругликов, И. А. Болосов, Е. И. Финкина, Т. В. Овчинникова (с. 203–217)

 

Белки теплового шока на поверхности опухолевых клеток как мишени для противоопухолевой терапии

А. О. Макарова, В. В. Костенко, О. В. Овсяникова, Е. В. Свирщевская, Г. В. Луценко, А. М. Сапожников (с. 218–230)

 

Биоинформатические подходы для детекции гибридных генов и продуктов транс-сплайсинга  (Дополнительные материалы)

И. Ю. Мусатов, М. И. Сорокин, А. А. Буздин (с. 231–255)

Синтез бифункциональных липофильных конструктов

Д. О. Анисимова, М. С. Савченко, А. Б. Тузиков, А. С. Парамонов, А. О. Чижов, Н. В. Бовин, И. М. Рыжов (с. 256–268)

 

Белок эпителия человека SLURP-2 как прототип ранозаживляющих препаратов

М. Л. Бычков, О. В. Шлепова, М. А. Шулепко, Д.С. Кульбацкий, Д. Бертран, А. В. Кириченко, З. О. Шенкарев, М. П. Кирпичников, Е. Н. Люкманова (с. 269–278)

​​

Новый белок глосаксин, состоящий из некаталитических доменов металлопротеиназы типа PIII, из яда щитомордника Gloydius saxatilis ингибирует никотиновый холинорецептор

А. В. Осипов, Е. В. Крюкова, Л. О. Оджомоко, И. В. Шелухина, Р. Х. Зиганшин, В. Г. Старков, Т. В. Андреева, В. И. Цетлин, Ю. Н. Уткин (с. 279–286)

Изоформы цитоскелетного белка зиксина в раннем эмбриогенезе шпорцевой лягушки Xenopus laevis

Э. Д. Иванова, Е. А. Паршина, А. Г. Зарайский, Н. Ю. Мартынова (с. 287–294)

Защитная группа α-карбоксила аспарагиновой кислоты в виде производных (5-оксооксазолидин-4-ил)уксусной кислоты требует особого внимания при ее использовании

В. Н. Азев, А. Н. Чулин, М. В. Молчанов, А. И. Мирошников (с. 295–300)

Гибридные белки, содержащие протеородопсин Exiguobacterium sibiricum

Л. Е. Петровская, Е. А. Крюкова, В. А. Большаков, Е. П. Лукашев, С. А. Силецкий, М. Д. Мамедов, Р. В. Судаков, Д. А. Долгих, М. П. Кирпичников (с. 301–310)

Структура внешнего гептамерного α-кольца 26S иммунопротеасомы человека в предактивационном состоянии, выявленная методом криоэлектронной микроскопии с разрешением 3.6 Å

Г. А. Саратов, Т. Н. Баймухаметов, А. Л. Коневега, А. А. Кудряева, А. А. Белогуров (с. 311–323)

Электронная микроскопия электрофоретических фракций природных гуминовых кислот – ключ к разгадке их структурной организации

О. Е. Трубецкая, О. М. Селиванова, В. В. Рогачевский, О. А. Трубецкой (с. 324–334)

Актуальность инженерно-технических решений, реализованных в филиале ИБХ РАН, и современные проблемы вивариев и питомников лабораторных животных

А. Н. Мурашев, Ф. А. Мещеряков (с. 335–337)

Фактор рибонуклеопротеиновых комплексов Ybx1 стабилизирует материнскую мРНК гена ssx2ip, кодирующего белок созревания центросом, в эмбриональном развитии лягушки Xenopus laevis

Е. А. Паршина, А. Г. Зарайский, Н. Ю. Мартынова (с. 338–344)

Пространственная организация флуоресцентного комплекса тройного мутанта бактериального липокалина с хромофором DiB3-F53L/F74L/L129M

А. В. Россохин, Е. А. Горячева, И. В. Артемьев, С. Ф. Архипова, А. Р. Гильванов, Н. В. Плетнева, В. З. Плетнев (с. 345–350)

24-3

ЖУРНАЛУ 50 ЛЕТ

Специальный номер, посвященный 90-летию со дня рождения основателя журнала академика РАН
Юрия Анатольевича Овчинникова

2024, том 50, номер 4

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

​​

МЕМОРИАЛЬНЫЙ ОБЗОР

Юрий Анатольевич Овчинников и я. Большое видится на расстоянии

Е. Д. Свердлов (с. 351–358)

ОБЗОРНЫЕ СТАТЬИ

Методы введения флуоресцентной метки в полисахариды

А. Ю. Нокель, Н. В. Бовин, А. Б. Тузиков, Т. В. Овчинникова, Н. В. Шилова (с. 359–378)

 

Архитектоника убиквитиновых цепей

К. А. Иванова, А. А. Белогуров, А. А. Кудряева (с. 379–397)

 

Трансмембранные домены биотопных белков – ключ к пониманию клеточной сигнализации

А. А. Полянский, Р. Г. Ефремов (с. 398–411)

Перспективные направления регулирования сигнальных путей, участвующих в развитии сахарного диабета второго типа

Н. А. Бороздина, Д. В. Попкова, И. А. Дьяченко (с. 412–435)

 

Биохимия редокс-активных соединений серы в клетках млекопитающих и подходы к их детекции

Р. И. Раевский, В. А. Катруха, Ю. В. Храмова, Д. С. Билан (с. 436–461)

​​

Современные методы флуоресцентной наноскопии в биологии

Д. О. Соловьева, А. В. Алтунина, М. В. Третьяк, К. Е. Мочалов, В. А. Олейников (с. 462–484)

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

Биотехнологический способ получения рекомбинантного двухкомпонентного лантибиотика лихеницидина в бактериальной системе экспрессии

Д. В. Антошина, С. В. Баландин, А. А. Тагаев, А. А. Потемкина, Т. В. Овчинникова (с. 485–497)

Производное нейротоксина BeM9 раскрывает особенности взаимодействия с изоформой натриевых каналов Nav1.5

М. А. Черных, М. А. Дюжева, Н. А. Кульдюшев, С. Пеньёр, А. А. Беркут, Я. Титгат, А. А. Василевский, А. О. Чугунов (с. 498–507)

Сверхбыстрая фотохимическая реакция родопсина Exiguobacterium sibiricum (ESR) при щелочном значении рH

О. А. Смитиенко, Т. Б. Фельдман, Л. Е. Петровская, Е. А. Крюкова, И. В. Шелаев, Ф. Е. Гостев, Д. А. Черепанов, И. Б. Кольчугина, Д. А. Долгих, В. А. Надточенко, М. П. Кирпичников, М. А. Островский (с. 508–516)

Влияние пептидных линкеров на функциональные свойства гибридных структур c избирательным рH-зависимым связыванием с раковыми клетками (Дополнительные материалы)

А. Ю. Фролова, А. А. Пахомов, С. М. Деев, В. И. Мартынов (с. 517–525)

Влияние эффекторов на каталитическую активность галактонолактоноксидазы из Trypanosoma cruzi

А. А. Чудин, Е. В. Кудряшова (с. 526–537)

Синтетические антимикробные пептиды. V. Гистидин-содержащие антигрибковые пептиды c “линейным” типом амфипатичности

Н. В. Амирханов, А. В. Бардашева, В. Н. Сильников, Н. В. Тикунова (с. 538–555)

Фоторасщепляемые направляющие РНК для фоторегулируемой системы CRISPR/Cas9

Е. А. Ахметова, И. П. Вохтанцев, М. И. Мещанинова, М. А. Воробьева, Д. О. Жарков, Д. С. Новопашина (с. 557–567)

ПИСЬМА РЕДАКТОРУ

Сравнительный анализ поведения Cy5-пиримидиновых нуклеотидов в реакции амплификации по типу катящегося кольца

С. А. Лапа, П. А. Чиркова, С. А. Суржиков, В. Е. Кузнецова, В. Е. Шершов, А. В. Чудинов (с. 568–573)

24-4

ЖУРНАЛУ 50 ЛЕТ

2024, том 50, номер 5

Статьи журнала по соглашению авторов с компанией Pleiades Publishing, Ltd. публикуются на английском языке в журнале “Russian Journal of Bioorganic Chemistry”, ISSN 1068-1620, ˝Pleiades Publishing, Ltd.

​​

ОБЗОРНЫЕ СТАТЬИ

Особенности аминокислотного состава желатинов из органов и тканей ряда сельскохозяйственных животных

С. Ю. Зайцев (с. 577–590)

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

Разработка метода флуоресцентно-констрастирующего иммуноокрашивания для 3D-визуализации астроцитарной ультраморфологии

К. Е. Мочалов, О. И. Сутягина, А. В. Алтунина, Д. О. Соловьева, А. Е. Ефимов, В. А. Жучков, С. П. Чумаков, В. А. Олейников (с. 591–600)

Производные 3-гидроксихиназолина, аналоги эрастина, индуцируют ферроптоз в клетках колоректального рака

В. Н. Осипов, А. А. Вартанян, Д. А. Хоченков, Д. В. Гусев, О. В. Фатеенкова, Д. С. Хачатрян, Л. М. Борисова (с. 601–611)

Структурно-функциональные особенности белок-полисахаридных комплексов на основе цистеиновых протеаз и гидрофильно модифицированного хитозана

М. С. Лавлинская, А. В. Сорокин, С. С. Гончарова, М. Г. Холявка, М. С. Кондратьев, В. Г. Артюхов (с. 612–621)

Подход к получению циклических фоторасщепляемых РНК для фотоактивируемой системы CRISPR/Cas9

Е. В. Иванская, М. И. Мещанинова, М. А. Воробьева, Д. О. Жарков, Д. С. Новопашина (с. 622–635)

Синтез пептидных фрагментов гликопротеина Spike SARS-CoV-2 и изучение их связывания с клетками крови человека

О. В. Грибовская, В. В. Янченко, А. М. Цыганков, В. П. Мартинович (с. 636–648)

АТР-зависимые LonBA-протеазы бацилл и клостридий

А. Г. Андрианова, А. М. Куджаев, И. В. Смирнов, Т. В. Ротанова (с. 649–656)

Boc/Bzl-твердофазный синтез пептида дельторфина II и его аналогов без применения безводного фтористого водорода

В. Н. Азев, Л. Г. Мустаева, Е. Ю. Горбунова, Л. К. Байдакова, А. Н. Чулин, Л. Н. Маслов, А. В. Мухомедзянов, М. В. Молчанов, А. И. Мирошников (с. 657–664)

ПИСЬМА РЕДАКТОРУ

Получение активных аминогрупп на поверхности полиэтилентерефталатной пленки и их количественная оценка для технологии биологических микрочипов

Г. Ф. Штылев, И. Ю. Шишкин, С. А. Лапа, В. Е. Шершов, В. Е. Барский, С. А. Поляков, В. А. Василисков, О. А. Заседателева, В. Е. Кузнецова, А. В. Чудинов (с. 665–671)

Иммобилизация белковых зондов на биочипах с ячейками из щеточных полимеров

Г. Ф. Штылев, И. Ю. Шишкин, В. Е. Шершов, В. Е. Кузнецова, Д. А. Качуляк, В. И. Бутвиловская, А. И. Левашова, В. А. Василисков, О. А. Заседателева, А. В. Чудинов (с. 672–685)

Выявление мутаций генов IDH1/2 в образцах опухоли c низкой представленностью мутантного аллеля

В. О. Варачев, Д. А. Гуськов, О. Ю. Сусова, А. П. Шехтман, Д. В. Рогожин, С. А. Суржиков, А. В. Чудинов, А. С. Заседателев, Т. В. Наседкина (с. 686–693)

Использование флуоресцентной времяразрешенной микроскопии для повышения селективности флуорогенных красителей ряда арилиден-имидазолонов в отношении эндоплазматического ретикулума (Дополнительные материалы)

А. Р. Гильванов, А. Ю. Смирнов, С. А. Краснова, И. Д. Соловьев, А. П. Савицкий, Ю. А. Богданова, М. С. Баранов (с. 694–701)

24-5
bottom of page